保密工资的发放通常有以下几种方式：
在职人员工资结构：
保密工资作为工资结构的一部分，随工资一起发放。
一次性发放：
保密工资可能按照一定的周期（如年度）一次性发放给员工。
保密抵押金：
保密工资可以从员工工资中扣除作为抵押金，如果没有泄密则全额返还。
离职人员保密费：
对于离职人员，可以根据事先约定的保密年限和保密费标准，在离职时或保密年限内发放保密费。
保密工资的目的主要是为了防止员工之间的攀比，影响情绪和制造内部矛盾，同时对外保密，保护企业的商业秘密和竞争地位。
需要注意的是，虽然企业可以发放保密费，但这并不意味着员工没有保密义务。根据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守商业秘密和知识产权相关的保密事项，并在解除或终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。