农保（新型农村合作医疗）在医院报销的流程通常如下：
住院费用报销
在本地就医：出院时直接报销，只需支付个人自付部分。
异地就医：需要携带身份证、户口本、病例、住院记录、医药费清单等材料到当地医保中心申请报销，有时还需提供工作证明。
报销比例
报销比例因医院等级不同而异，通常镇卫生院报销比例较高，三级医院较低。
报销流程
参保人员在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可直接刷卡报销。
在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结帐时直接刷卡报销。
市外二级及以上公立医疗机构住院治疗，出院后3个月内提交相关资料到新农合窗口报销。
特殊情形
危急重症抢救未及时办理转诊手续或在非协议管理医疗机构入院治疗的，可在报统筹地区城乡居民医保经办机构同意备案后报销。
注意事项
确保在定点医院就医，并出示医保卡以证明参保身份。
医保系统会自动结算可报销费用，患者只需支付自付部分。
妥善保管费用发票和单据，以便报销时提交。
请根据您的具体情况选择合适的报销方式，并确保在规定的时间内完成报销手续。